18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1819 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1819  ExsB family protein  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1080  ExsB family protein  88.12 
 
 
261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0837  ExsB family protein  83.52 
 
 
261 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265876  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0902  ExsB family protein  62.84 
 
 
262 aa  339  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0037  ExsB family protein  47.51 
 
 
257 aa  236  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  30.57 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  25.13 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1107  putative ATP binding related protein  26.26 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  26.22 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  25.33 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  26.35 
 
 
295 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  28.07 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  27.49 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  27.4 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  25.5 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  24.84 
 
 
352 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  27.37 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  33.04 
 
 
268 aa  42  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>