28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1479 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
213 aa  433  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  97.18 
 
 
213 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.24 
 
 
213 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.77 
 
 
213 aa  292  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.35 
 
 
231 aa  161  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  39.41 
 
 
212 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 
217 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  40.37 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  36.19 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.49 
 
 
206 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  35.71 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 
197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
207 aa  108  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  35 
 
 
198 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  32.66 
 
 
198 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.97 
 
 
145 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  30.37 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  31.75 
 
 
233 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  54.55 
 
 
147 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  45.16 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  38.05 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.73 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  37.65 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  36.47 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
235 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>