22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1360 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1360  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  100 
 
 		 285 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.63655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0024  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  48.54 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2131  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  43.77 
 
 		 291 aa  205  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1870  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.31 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.03 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  28.51 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  29.5 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  29.34 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  32.12 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  30.3 
 
 		 230 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  24.88 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  27 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.26 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  27.45 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  27.94 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>