13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0001 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00371061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0011  tRNA-Ser  90.8 
 
 
87 bp  95.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176232  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0009  tRNA-Ser  89.29 
 
 
84 bp  95.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0069  tRNA-Ser  88.37 
 
 
86 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.980326  normal  0.628883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0003  tRNA-Ser  84.42 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.503711  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0040  tRNA-Ser  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412277  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0001  tRNA-Ser  91.67 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>