14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1225 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  659    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  26.94 
 
 
515 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
506 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 
509 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
505 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  24.35 
 
 
502 aa  85.9  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  26.88 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  27.11 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
223 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3406  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 
342 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.317826  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  25.43 
 
 
232 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0487  TIM-barrel protein, nifR3 family  23.47 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663331 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
230 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>