20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0554 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  867    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  84.74 
 
 
439 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  99.77 
 
 
439 aa  866    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  83.14 
 
 
439 aa  706    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  76.54 
 
 
439 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  37.38 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  37.53 
 
 
469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  36.93 
 
 
445 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  38 
 
 
419 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  30.56 
 
 
454 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  28.94 
 
 
463 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  32.57 
 
 
433 aa  113  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  28.39 
 
 
477 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  29.82 
 
 
558 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  30.89 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0185  hypothetical protein  25.77 
 
 
489 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  31.44 
 
 
519 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4401  hypothetical protein  27.3 
 
 
533 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0879683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2229  hypothetical protein  27.1 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239901  hitchhiker  0.0000156459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>