30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5440 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  309  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4305  hypothetical protein  55.65 
 
 
192 aa  135  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3318  hypothetical protein  38.35 
 
 
216 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.329513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  50.91 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  48.28 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  43.94 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  49.12 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  43.94 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  43.08 
 
 
78 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  40.68 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  47.27 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  35.38 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  38.18 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  36.51 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  36.51 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  46.3 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  39.68 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20520  hypothetical protein  48.08 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  36.51 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  39.29 
 
 
73 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  40.32 
 
 
240 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4394  hypothetical protein  35.59 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  40.32 
 
 
239 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4880  hypothetical protein  46.34 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.407704  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  55.88 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>