22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3698 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3698    100 
 
 
1308 bp  2593    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442289  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  99.46 
 
 
1863 bp  1800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  94.12 
 
 
1641 bp  103  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  83.48 
 
 
1746 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  83.48 
 
 
1737 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  83.48 
 
 
1746 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  83.48 
 
 
1737 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1066    83.48 
 
 
2897 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  83.48 
 
 
1737 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  83.48 
 
 
1737 bp  77.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  88.06 
 
 
1575 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  86.76 
 
 
1812 bp  63.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  86.57 
 
 
1782 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  86.57 
 
 
1608 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  86.57 
 
 
1554 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  86.57 
 
 
1782 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  87.72 
 
 
1560 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  96.77 
 
 
1560 bp  54  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  96.67 
 
 
1551 bp  52  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1097    100 
 
 
328 bp  48.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  100 
 
 
1329 bp  48.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  96.43 
 
 
3447 bp  48.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>