36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4141 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  98.48 
 
 		 331 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 335 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  94.29 
 
 		 336 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  75.95 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  71.11 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  59.29 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  59.17 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  48.53 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  51.91 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  36.94 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  36.66 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  39.52 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  36.57 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  38.57 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  35.07 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  33.74 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  35.22 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  37.8 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  34.09 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  36.99 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  36.99 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  45.31 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  35.53 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.05 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  35.94 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  30.68 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  42.19 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  27.15 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.7 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  39.34 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  37.7 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  32.31 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  37.7 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.19 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>