14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2904 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3130  hypothetical protein  97.96 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.81644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3028  hypothetical protein  83.67 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2726  hypothetical protein  64.86 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5007  hypothetical protein  56.76 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351742  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4398  hypothetical protein  66.67 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1367  hypothetical protein  52.27 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1387  hypothetical protein  57.89 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4705  hypothetical protein  47.92 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2772  hypothetical protein  52.27 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7002  hypothetical protein  56.1 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4029  hypothetical protein  48.89 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3571  hypothetical protein  47.83 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3240  hypothetical protein  53.12 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>