55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2030 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2030  putative ferredoxin-NAD reductase component  100 
 
 		 313 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2305  putative ferredoxin-NAD reductase component  99.04 
 
 		 313 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0479254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1991  putative ferredoxin-NAD reductase component  92.65 
 
 		 313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1592  putative ferredoxin-NAD reductase component  56.65 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0274  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.03 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2336  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.59 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126537  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0136  ferredoxin  36.79 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0780915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2675  ferredoxin  36.62 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.237463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0219  ferredoxin  37.3 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  27.62 
 
 		 419 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  29.75 
 
 		 344 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.92 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.1 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.93 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  26.05 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0711  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  22.83 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.49 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.61 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.95 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  24.05 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  27.1 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  28.39 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  23.91 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.43 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  28.65 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.37 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  22.36 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.52 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  24.37 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.27 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  25.82 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.82 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  32.99 
 
 		 599 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.42 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  29.38 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.98 
 
 		 562 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  24.12 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  29.38 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.06 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  29.38 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.63 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  23.4 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0217103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.06 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  24.41 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  24.71 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  24.11 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.56 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>