18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1841 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  97.97 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  93.4 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  73.98 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  71.67 
 
 		 198 aa  258  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  70.56 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  49.16 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  50.28 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  50.57 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  48.9 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  46.94 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  48.6 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  46.2 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  48 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  45.56 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  31.66 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  23.44 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>