20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0311 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  85.77 
 
 		 512 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  98.25 
 
 		 513 aa  971    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  53.54 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  38.15 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  37.88 
 
 		 505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  36.29 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  37.96 
 
 		 480 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  34.08 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  34.08 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  32.92 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  34.03 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  33.06 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  30.24 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  33.27 
 
 		 474 aa  183  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  35.57 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  41.59 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  41.96 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  25.45 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  25.45 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>