12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0157 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  44.23 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  34.85 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  44.9 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>