19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3141 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  344  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  30.77 
 
 
277 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  35.44 
 
 
321 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  32.26 
 
 
274 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  33 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  29.06 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34610  hypothetical protein  31.19 
 
 
263 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0562  hypothetical protein  37.78 
 
 
336 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  29.69 
 
 
201 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  29.71 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  29.75 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  26.96 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  25.25 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  26.72 
 
 
220 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0810  hypothetical protein  33.04 
 
 
290 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  28.07 
 
 
319 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0052  hypothetical protein  35.56 
 
 
289 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>