33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2137 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  260  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  49.3 
 
 
138 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  49.19 
 
 
155 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  49.58 
 
 
150 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  48 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  40.35 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  40.59 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  38.37 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  80 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  72 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  58.7 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  73.08 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0987  hypothetical protein  35.94 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.283754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  39.02 
 
 
235 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  42.31 
 
 
209 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  64.52 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  72 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  56.67 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  72 
 
 
201 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  53.49 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  76 
 
 
196 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  53.49 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  53.49 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  68 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  35.45 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  73.08 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  68 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  68 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  64 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  35.23 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>