16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0003 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0016  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.190715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0003  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0052  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.717648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0057  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000607595  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0058  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000626368  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0059  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000522849  normal  0.720074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0060  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000123741  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0061  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000126169  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0062  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112705  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0064  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000484105  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0072  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18023  normal  0.42489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0058  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>