20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2341 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  100 
 
 
114 aa  228  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  51.35 
 
 
118 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  49.55 
 
 
123 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  50.46 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  53.47 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  48.67 
 
 
112 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  48.25 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  53.33 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  46.36 
 
 
109 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  49.04 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  46.79 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  48.45 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  46.79 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  48.25 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  53.47 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  48.25 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  50.96 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0518  hypothetical protein  28.32 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117403  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.967687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>