17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1192 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1192  VRR-NUC domain protein  100 
 
 
111 aa  226  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.476317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0562  VRR-NUC domain protein  30.3 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1270  VRR-NUC domain-containing protein  33.33 
 
 
92 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1207  VRR-NUC domain-containing protein  33.33 
 
 
92 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0372  VRR-NUC domain-containing protein  33.33 
 
 
92 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1827  VRR-NUC domain-containing protein  33.33 
 
 
91 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3056  VRR-NUC domain protein  32.58 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000260708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1197  hypothetical protein  34.72 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0621965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1175  hypothetical protein  32.26 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0397018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1483  hypothetical protein  32.26 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0425  hypothetical protein  32.26 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1646  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.650726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1097  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.938002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  32.67 
 
 
129 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  31.68 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  32.67 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  32.67 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>