16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1727 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1727  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  384  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1414  hypothetical protein  56.22 
 
 
185 aa  209  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.378071  normal  0.11817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0685  protein of unknown function DUF447  55 
 
 
187 aa  209  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0665  hypothetical protein  46.41 
 
 
202 aa  174  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1107  hypothetical protein  48.09 
 
 
188 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  40 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1607  hypothetical protein  38.89 
 
 
215 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.536381  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  37.7 
 
 
193 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0765  protein of unknown function DUF447  26.6 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  22.49 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2337  protein of unknown function DUF447  28.57 
 
 
215 aa  44.7  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0425454  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  23.94 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2584  protein of unknown function DUF447  28.19 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.735694  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  23.94 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0035  protein of unknown function DUF447  25.91 
 
 
222 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1890  protein of unknown function DUF447  28.68 
 
 
227 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>