15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4940 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  347  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.260804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4476  hypothetical protein  97.19 
 
 		 179 aa  336  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4990  hypothetical protein  87.71 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604608  normal  0.264456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1416  hypothetical protein  68.11 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000277673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5029  hypothetical protein  59.18 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366968  normal  0.0139556 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11157  conserved hypothetical protein  47.1 
 
 		 250 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2889  hypothetical protein  48.28 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216449  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2685  hypothetical protein  43.97 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.214698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2306  hypothetical protein  44.29 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1762  hypothetical protein  44.86 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2246  Ku protein  45.45 
 
 		 340 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  36.78 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  34.18 
 
 		 108 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  35.44 
 
 		 111 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  45.31 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>