23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1830 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  308  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  308  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1690  hypothetical protein  94.19 
 
 
163 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  57.14 
 
 
181 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  48.12 
 
 
173 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6821  hypothetical protein  51.13 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  46 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0739  hypothetical protein  39.81 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740203  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  32.5 
 
 
214 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  31.08 
 
 
197 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  29.82 
 
 
274 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  29.82 
 
 
274 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  28.46 
 
 
321 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  31.2 
 
 
226 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0536  hypothetical protein  46.67 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  24 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  25.9 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  30.82 
 
 
162 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4180  hypothetical protein  42.11 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  26.43 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  27.74 
 
 
182 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0522  hypothetical protein  31.2 
 
 
196 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>