14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1879 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1879  prefoldin, alpha subunit  100 
 
 
180 aa  360  4e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0986301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0542  prefoldin, alpha subunit  54.93 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000518948  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1966  prefoldin, alpha subunit  55.97 
 
 
149 aa  141  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3021  prefoldin alpha subunit  50.72 
 
 
149 aa  141  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1477  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  103  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000022612  hitchhiker  0.000493368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1364  prefoldin subunit alpha  32.59 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0395  prefoldin subunit alpha  33.08 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0549936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0780  prefoldin subunit alpha  31.3 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0108  prefoldin subunit alpha  31.3 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0756158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1203  prefoldin subunit alpha  29.57 
 
 
144 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0715  prefoldin subunit alpha  27.83 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.347569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0430  prefoldin, alpha subunit  33.03 
 
 
129 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0111  prefoldin subunit alpha  28.45 
 
 
138 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.162217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0238  prefoldin, alpha subunit  41.56 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>