8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0055 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00788362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>