11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0007 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0005  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.150884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0007  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0934389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0062  tRNA-Asn  96.49 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0045  tRNA-Asn  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.112138  normal  0.31939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0048  tRNA-Asn  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0005  tRNA-Asn  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0042  tRNA-Asn  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0064  tRNA-Asn  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.468559  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  86.54 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0061  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
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