More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0193 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0026  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2604  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1997  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149702  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0185  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1780  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0016  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106062  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2560  tRNA-His  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2558  tRNA-His  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000105992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0144  tRNA-His  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00158556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0048  tRNA-His  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000560154  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0069  tRNA-His  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000556793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0453  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000219585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0708592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000107091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0041  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0042  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000129233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000083016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>