25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1893 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  206  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  48.39 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0164  hypothetical protein  43.88 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  28.43 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  34.74 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  28.12 
 
 
118 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  32.95 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  28.43 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  29.17 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  30.34 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  34.78 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  32.93 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  35.63 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  26.88 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  25.51 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  24.75 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  24.11 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  27.27 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  24.75 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  26.74 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  23.47 
 
 
107 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1048  hypothetical protein  32.58 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.487326  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  23.47 
 
 
107 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>