13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1487 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1487  hypothetical protein  100 
 
 
764 aa  1543    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330928  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1476  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199967  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1477  hypothetical protein  28.47 
 
 
351 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3724  hypothetical protein  25.79 
 
 
424 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1079  hypothetical protein  44.83 
 
 
582 aa  55.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1107  hypothetical protein  28.7 
 
 
695 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3182  hypothetical protein  44.83 
 
 
582 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  26.02 
 
 
657 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1127  hypothetical protein  26.61 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.582071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  25.28 
 
 
657 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  25.94 
 
 
747 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1699  hypothetical protein  24.58 
 
 
489 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.72795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1718  hypothetical protein  25 
 
 
508 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.586514 
 
 
-
 
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