26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2603 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  54.67 
 
 
80 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  45.45 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  41.1 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  40.91 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  41.67 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  34.67 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  38.03 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  40.3 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  39.39 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  36.59 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  35.38 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  39.47 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  37.88 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  41.54 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  35.21 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  38.89 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  39.71 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  31.51 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  30.99 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  27.63 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  34.72 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  32.84 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>