23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1530 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  100 
 
 		 308 aa  614  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  39.03 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  39.12 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  38.46 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  38.65 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  35.5 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  39.52 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  39.52 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  37.91 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  39.52 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  37.59 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  36.46 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  37.64 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  36.94 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  36.65 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  34.17 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  27.21 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  35.62 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  22.59 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>