17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1244 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  60.53 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  56.25 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  56.6 
 
 		 193 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  59.6 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  53.33 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  54.91 
 
 		 199 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  55.41 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  51.45 
 
 		 196 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  51.55 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  51.97 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  50.66 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  48.67 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  48 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  48 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  47.68 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  31.52 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>