71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04102 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04102  ribonuclease P  100 
 
 		 55 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000363404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  67.27 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  59.62 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  56 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  56 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  49.02 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  52 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  48.94 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  55.32 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  43.14 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  50 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  43.14 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  48.94 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  46.81 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  46.81 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  46.81 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  46.81 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  50 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  41.18 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  43.14 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  41.18 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  48.94 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  41.18 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  50 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  46.81 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  46.81 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  47.92 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  46.81 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  46 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  40 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  38 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  45.28 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  47.92 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  45.1 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  34 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2120  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>