42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02145 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  289  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  48.55 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  45.26 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  51.43 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  48.03 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  36.29 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  41.27 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  50.54 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  39.84 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  38.58 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  38.58 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  38.58 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  45.88 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  38.58 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  42.7 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  34.4 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  40.65 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  45.21 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  45.21 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  43.84 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  44.93 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  46.67 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  35.85 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  30.84 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  29.2 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  32.73 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  31.48 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  31.48 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  29.57 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  26.5 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  33.65 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  37.93 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  32.11 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  29.91 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  32.73 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  32.08 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>