22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01038 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  177  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  67.86 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  66.67 
 
 
83 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  62.79 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3807  hypothetical protein  54.02 
 
 
85 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  58.54 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0085  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0262  hypothetical protein  56.25 
 
 
93 aa  83.6  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.623777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  57.32 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16910  hypothetical protein  57.83 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331531  normal  0.123249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0296  hypothetical protein  46.84 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0873  hypothetical protein  53.01 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3839  hypothetical protein  52.94 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1565  hypothetical protein  47.67 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.679201  hitchhiker  0.00228497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4747  hypothetical protein  51.25 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917471  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1968  hypothetical protein  47.5 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128383  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  46.15 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  53.33 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  56.67 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  48.94 
 
 
108 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  53.33 
 
 
130 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  55.17 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>