18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5541 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5541  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0085  hypothetical protein  49.2 
 
 
387 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.56108  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0078  hypothetical protein  48.02 
 
 
399 aa  328  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0167  hypothetical protein  47.85 
 
 
387 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0013  hypothetical protein  36 
 
 
257 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1614  hypothetical protein  34.16 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0225237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1300  hypothetical protein  32.14 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4319  hypothetical protein  32 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6764  hypothetical protein  30.77 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167002 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0076  hypothetical protein  27.03 
 
 
514 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01110  hypothetical protein  30.28 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1263  hypothetical protein  31.61 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0235  hypothetical protein  22.33 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2859  hypothetical protein  35.23 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01487  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4379  hypothetical protein  41.3 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0296  hypothetical protein  34.78 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209402  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0210  hypothetical protein  39.58 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>