16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0235 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4379  hypothetical protein  97.34 
 
 		 301 aa  563  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2859  hypothetical protein  30.62 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01487  hypothetical protein  34.56 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01110  hypothetical protein  26.89 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1300  hypothetical protein  29.45 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.56108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0167  hypothetical protein  31.52 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0013  hypothetical protein  32.14 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5541  hypothetical protein  22.33 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0078  hypothetical protein  30.85 
 
 		 399 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0225237 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4319  hypothetical protein  29.35 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0210  hypothetical protein  37.25 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0076  hypothetical protein  37.7 
 
 		 514 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4169  hypothetical protein  38.46 
 
 		 382 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>