24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3597 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  54.01 
 
 
290 aa  298  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  59.62 
 
 
275 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  51.99 
 
 
288 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  54.33 
 
 
285 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  48.66 
 
 
280 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  47.73 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  47.73 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  47.17 
 
 
280 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  42.75 
 
 
284 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  51.12 
 
 
277 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  46.27 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  44.91 
 
 
298 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  42.55 
 
 
300 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  42.55 
 
 
298 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  43.22 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  44.23 
 
 
280 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  42.55 
 
 
300 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  24.34 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  25.28 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  27.86 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  26.29 
 
 
514 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>