12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1857 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1857    100 
 
 		 474 bp  940    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  83.62 
 
 		 993 bp  321  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  83.24 
 
 		 972 bp  230  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8691    81.65 
 
 		 487 bp  222  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  84.05 
 
 		 825 bp  216  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6851    81.12 
 
 		 676 bp  200  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7029    94.87 
 
 		 183 bp  184  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000000656657  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1965    78.19 
 
 		 548 bp  99.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3946    84.06 
 
 		 314 bp  99.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  90.91 
 
 		 999 bp  56  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0692    90.91 
 
 		 873 bp  56  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  90.91 
 
 		 1032 bp  56  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>