More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0044 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  97.18 
 
 		 77 bp  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  95.95 
 
 		 80 bp  123  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0062  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3153  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.311913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0070  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0792206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3547  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.226089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4079  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4492  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3646  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0070  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0063  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0070  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0467546  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0068  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0029  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0069  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.043282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3201  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.145985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3135  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3136  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.364243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3584  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3315  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4080  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3316  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4081  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0905537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0069  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0763001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0027  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3479  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.344656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0104  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000123497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>