15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2339 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  257  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  257  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  52 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  42.98 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  39.67 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  34.43 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  38.21 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  41.32 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  36.29 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  36.29 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  33.07 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>