20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2038 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  99.77 
 
 		 431 aa  887    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  959    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  44.92 
 
 		 448 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  41.67 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  46.61 
 
 		 120 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  27.61 
 
 		 480 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  27.46 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  26.87 
 
 		 503 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  23.84 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  23.63 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  26.38 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  37.39 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  37.39 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  36.36 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  33.91 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  31.71 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  21.95 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  27.19 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  25.88 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  22.87 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>