61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1956 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2316  outer membrane lipoprotein Slp, putative  100 
 
 		 178 aa  356  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.884572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1956  outer membrane lipoprotein Slp  100 
 
 		 178 aa  356  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0861  outer membrane lipoprotein Slp  43.18 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02439  outer membrane protein Slp  43.59 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2173  Slp family outer membrane lipoprotein  36.99 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2420  outer membrane lipoprotein Slp  32.68 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.0108754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0667  outer membrane lipoprotein, Slp family  38.13 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1325  Outer membrane lipoprotein Slp  35.66 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2806  Slp family outer membrane lipoprotein  30.95 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0323453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2348  outer membrane lipoprotein, Slp family  33.79 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01135  Starvation-inducible outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1119  outer membrane lipoprotein Slp  47.06 
 
 		 107 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1619  Outer membrane lipoprotein Slp  34.78 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2260  Slp family outer membrane lipoprotein  36.75 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1572  putative outer membrane lipoprotein Slp  33.33 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0668  outer membrane lipoprotein Slp  32.58 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0908  outer membrane lipoprotein, Slp family  31.78 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2347  outer membrane lipoprotein Slp  32.21 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.831306  normal  0.890388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0543  Slp family outer membrane lipoprotein  28.86 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2761  Slp family outer membrane lipoprotein  30.68 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000231326  hitchhiker  0.00115108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2419  outer membrane lipoprotein Slp  32.56 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1497  outer membrane protein Slp  31.07 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1959  outer membrane protein Slp  31.07 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2020  outer membrane protein Slp  31.07 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.251668  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1312  outer membrane protein Slp  31.07 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0266673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2376  Slp family outer membrane lipoprotein  29.1 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1963  outer membrane protein Slp  30.51 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2184  Slp family outer membrane lipoprotein  30.41 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1817  Slp family outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01377  hypothetical protein  25.49 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004092  starvation lipoprotein Slp like protein  25 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2533  outer membrane protein Slp  29.79 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2207  outer membrane lipoprotein Slp  29.2 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2066  outer membrane protein Slp  28.72 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2404  Slp family outer membrane lipoprotein  29.52 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000394448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1382  outer membrane protein Slp  30.61 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.387794  normal  0.55237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2126  Slp family outer membrane lipoprotein  29.52 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2172  outer membrane lipoprotein Slp  31.31 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1429  Outer membrane lipoprotein Slp  27.91 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00755368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2015  Slp family outer membrane lipoprotein  29.52 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000421651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1827  Slp family outer membrane lipoprotein  29.45 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64405  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2032  outer membrane protein Slp  29.45 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1894  outer membrane protein Slp  29.45 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1837  outer membrane lipoprotein, Slp family  29.45 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2230  outer membrane lipoprotein, Slp family  28.93 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01776  predicted lipoprotein  28.77 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.994959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01764  hypothetical protein  28.77 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.736998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2011  outer membrane lipoprotein, Slp family  28 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3107  putative starvation-inducible outer membrane lipoprotein  25.76 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03307  hypothetical protein  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0211  Slp family outer membrane lipoprotein  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4854  outer membrane lipoprotein, Slp family  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3904  outer membrane lipoprotein, Slp family  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3992  Slp family outer membrane lipoprotein  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3708  Slp family outer membrane lipoprotein  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00034327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0208  outer membrane lipoprotein, Slp family  24 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03354  outer membrane lipoprotein  24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3799  Slp family outer membrane lipoprotein  24 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1992  outer membrane lipoprotein, Slp family  26.72 
 
 		 209 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1935  outer membrane lipoprotein, Slp family  25.56 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2057  outer membrane lipoprotein Slp  24.53 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000642718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>