12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3034 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1884  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0973  hypothetical protein  30.81 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1962  hypothetical protein  35 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0828  hypothetical protein  29.63 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.734723  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4340  hypothetical protein  30.65 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142326  normal  0.0705595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1501  hypothetical protein  30.77 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0860  hypothetical protein  27.27 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2831  hypothetical protein  29.8 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3814  hypothetical protein  26.94 
 
 		 423 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1739  hypothetical protein  23.42 
 
 		 409 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1500  hypothetical protein  26.83 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>