34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2649 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  29.76 
 
 		 369 aa  48.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  28.09 
 
 		 363 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0878  putative acetyltransferase protein  38.71 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2537  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241408  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  35.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  35.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  35.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  35.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  35.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  35.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  31.82 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14360  acetyltransferase  27.88 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0566  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 		 173 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.60492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 		 381 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4070  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.55 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.246804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.55 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  31.03 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  33.8 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  43.64 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.445128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>