24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1416 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  63.46 
 
 		 281 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  60.23 
 
 		 280 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  51.72 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  50.92 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  50.35 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  49.46 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  52.16 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  52.16 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  45.14 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  45.07 
 
 		 298 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  49.07 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  51.81 
 
 		 300 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  50.2 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  45.08 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  47.53 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  47.17 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  43.91 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  43.22 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  45.96 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  25.72 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  26.72 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  25.78 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  24.37 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>