66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0810 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  40.15 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  36 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  37.14 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  34.87 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  29.82 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  29.17 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  31.02 
 
 		 286 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  29.69 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  27.89 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  31.4 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  30.58 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  30.86 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  29.3 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  27.8 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  28.42 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  27.95 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  27.4 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  28.62 
 
 		 353 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  27.27 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  26.39 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  28.26 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  27.48 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  30.25 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  25.58 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  28.3 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  24.91 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  24.91 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  27.48 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  25.95 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  30.89 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  26.32 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  23.3 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  24.91 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  26.88 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  28.57 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  24.55 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  25.09 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  28.44 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  26.32 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  25.09 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  24.21 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  28.44 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  25.68 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  40.74 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  24.64 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  24.59 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  25.1 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  25 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  26.11 
 
 		 631 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  24.63 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  29.11 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  25.93 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  24.63 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.63 
 
 		 417 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.63 
 
 		 404 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.63 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  36.49 
 
 		 334 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3220  hypothetical protein  24.27 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.46717  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.55 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.41 
 
 		 688 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  26.34 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.96 
 
 		 653 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  22.88 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  24.43 
 
 		 289 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>