20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0250 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  251  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  65 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  76 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  64.35 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  69.81 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  57.03 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  63.64 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  67.31 
 
 		 113 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  72 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  66.37 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  66.37 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  68.27 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  68.27 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  61.47 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  62.77 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  64.71 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  62.5 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  50.96 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  34.09 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>