26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1257 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1257  glycopeptide antibiotics resistance protein  100 
 
 
200 aa  401  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000512133  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  32.32 
 
 
148 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  32.8 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5212  hypothetical protein  36.03 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4846  hypothetical protein  36.03 
 
 
248 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  31.21 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  41.89 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5083  hypothetical protein  37.69 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  29.01 
 
 
185 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  39.19 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  39.19 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  31.35 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  39.19 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5115  hypothetical protein  44.29 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  42.65 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  31.87 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  33.55 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  36.49 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  36.49 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  37.14 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  27.22 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  32.24 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  36.36 
 
 
156 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0097  VanZ like protein  30.67 
 
 
416 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3207  protein VanZ  25.18 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0068  VanZ like protein  30.56 
 
 
440 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>