299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t2170 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t2170  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.105241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0561  tRNA-Gly  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  94.34 
 
 		 777 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1225  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.199652  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6044  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1033  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.573646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0012  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000023664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0058  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.585582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0195  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5141  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000127094  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5654  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000615914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000301735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000445849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000721816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0216  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000219569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0174  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0040  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.634702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0537  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26138e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0031  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000029648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0046  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.098729  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5657  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.7717399999999996e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0040  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000405897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000121451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0012  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000311563  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0058  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>