34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12830 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  100 
 
 
248 aa  486  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  48.82 
 
 
206 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  49.76 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  49.76 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  48.82 
 
 
205 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  46.01 
 
 
209 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  49.28 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  47.69 
 
 
210 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  47.17 
 
 
207 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  45.07 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  41.74 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  44.29 
 
 
209 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  45.96 
 
 
210 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  38.97 
 
 
209 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  39.15 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  42.7 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  38.16 
 
 
214 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  43.65 
 
 
203 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  42.93 
 
 
207 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  39.05 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  35.85 
 
 
214 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  39.07 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  36.95 
 
 
210 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  38.83 
 
 
210 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  38.69 
 
 
207 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  37.12 
 
 
240 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  35.58 
 
 
209 aa  93.6  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  39.78 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  29.75 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  29.75 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>